Оценка государственных программ должна отражать не только степень исполнения запланированных мероприятий и достижения установленных показателей, но и дополнительный социально-экономический результат, обусловленный самим программным воздействием. Цель исследования состоит в развитии методического подхода к оценке результативности государственных программ посредством объединения логики результатов и контрфактического анализа. Разграничены ресурсы программы, непосредственные продукты её реализации, промежуточные результаты и конечные социально-экономические эффекты. Для ситуаций, в которых возможно сформировать сопоставимую группу объектов, не получивших поддержку, предложено использовать метод разности разностей. Его применение продемонстрировано на пилотном примере региональной поддержки предприятий перерабатывающей промышленности. В исходной группе поддержки средний объём отгруженной продукции в расчёте на одно предприятие увеличился со 145,2 до 188,6 млн руб., или на 43,4 млн руб.; в группе сравнения — со 142,8 до 156,3 млн руб., или на 13,5 млн руб. Расчётная двойная разность составляет 29,9 млн руб. на одно предприятие. Данное значение следует рассматривать как предварительную оценку дополнительного эффекта программы; причинная интерпретация возможна только при выполнении предпосылки параллельных трендов, отсутствии сопутствующих воздействий, различающихся между группами, и сопоставимости состава исследуемых групп. Предложена многоуровневая схема оценки, в которой текущий мониторинг выполнения государственной программы дополняется анализом достижения конечных результатов, оценкой воздействия и, при наличии необходимых данных, анализом экономической эффективности. Сделан вывод о целесообразности избирательного применения контрфактических методов к наиболее значимым мерам государственной поддержки с обязательным раскрытием структуры данных, условий идентификации эффекта и статистической неопределённости оценки.